Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
BİO 5034	HÜCRE YAPI VE İŞLEVİNİN BİYOKİMYASAL TEMELLERİ	ZORUNLU	3	0	0	6

Dersi Veren Birim

Biyokimya Yüksek Lisans

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

PROFESÖR KEMAL BAYSAL

Dersi Alan Birimler

Biyokimya Yüksek Lisans

Dersin Amacı

Tıbbi Biyokimya Anabilim dalı yüksek lisans programında verilen 5007 dersinde hücre biyokimyasının temel konuları aktarılmaktadır. 5007 dersinden sonra alınması zorunlu olacak olan bu derste, 5007 de işlenen hücre biyolojisi konuları ileri konular bazında sürdürülecektir. Bu amaçla ele alınacak konular; genom yapısı, gen ekspresyonu ve fenotiple ilişkisi, hücre içi organeller, mitokondrinin biyoenerjetik dışındaki görevleri, apoptoz, otofaji, mitoz-mayoz, damarlanma, kanser gelişimi ve kök hücrelerde yapı-işlev ilişkileridir.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	Genomun yapısı ve organizasyonunu, translokasyonlar, genom dizisinde hataların tamir mekanizmaları hakkında bilgi edinmiş olmalıdır
2	mRNA yapısı, türleri ve fenotipi oluşturmada önemi konusunda bilgi edinmiş olmalıdır.
3	Mitokondrinin sentez işlevi, yapısındaki özgül transport proteinleri ve enerji metabolizmasının dışındaki hücresel işlevleri hakkında bilgi edinmiş olmalıdır.
4	Hücre iskeleti, hareketi ve ekstraselüler matriks yapısı ve bunun hücrelerle etkileşimlerini kavramış olmalıdır.
5	Hücre ölüm mekanizmaları, mitoz ve mayoz bölünme hakkında bilgi edinmiş olmalıdır.
6	Damar biyolojisinde temel kavramları ve önemli patolojik değişimleri öğrenmiş olmalıdır.
7	Kanser gelişimi ve kök hücre özelliklerini kavramış olmalıdır.
8	Derste seçilen bir makaleyi hazırlayarak ödev olarak sunabilmelidir.

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	Ders Tanıtımı: Hücreye giriş. Temel yapı taşları, hücrenin görüntülenmesi.	(Prof. Dr. Kemal Baysal)
2	Genomun ayrıntılı incelenmesi: ekzon, intron ve translokasyonlar. Genom dizisinde değişiklik yöntemleri. DNA tamir mekanizmaları.	(Prof. Dr. Kemal Baysal)
3	Gen ekspresyonu ileri konular: mRNA farklı kesim, kodlanmayan RNA lar. Genotip-fenotip ilişkisi, hücreye özgü gen ekspresyonu.	(Prof. Dr. Kemal Baysal)
4	Sentezlenen proteinlerin matürasyonu ve hücre içi trafiği.	(Prof. Dr. Semra Koçtürk)
5	Mitokondri biyogenezi, mitokondrinin sentez işlevi, yapısındaki özgül transport proteinleri ve enerji metabolizmasının dışındaki hücresel işlevleri.	(Prof. Dr. Gülgün Oktay)
6	Hücrede diğer organeller; işlevleri. Nükleus, lizozom, mikrozom.	(Prof. Dr. Kemal Baysal)
7	Hücre iskeleti, iskelet proteinleri, hücre hareketi.	(Prof. Dr. Gülgün Oktay)
8	Ekstraselüler matriks, integrinler, farklı ESM yapıları.	(Prof. Dr. Gülgün Oktay)
9	Damar biyolojisi: Anjiyogenez, ateroskleroz ve mekanizmaları.	(Prof. Dr. Kemal Baysal)
10	Hücre bölünmesi ve kontrolü. Mitoz, mayoz.	(Prof. Dr. Kemal Baysal)
11	Hücre ölümü; apoptoz ve mekanizmaları.	(Prof. Dr. Semra Koçtürk)
12	Diğer hücre ölüm mekanizmaları (otofaji vb).	(Prof. Dr. Semra Koçtürk)
13	Kontrolsüz hücre çoğalması: kanser. Epitelyal-mezankimal tranzisyon.	(Prof. Dr. Kemal Baysal)
14	Kök hücre biyolojisi Mezenkimal kök hücre, pluripotent kök hücre, farklılaşma, iPS	(Prof. Dr. Kemal Baysal)

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Ana kaynak:
1. Cell Biology. Karp G. 6th Ed. 2010 John Wiley & Sons.

Yardımcı kaynaklar:
1. Mitochondria: A Practical Approach. Darley-Usmar UM, Rickwood D & Wilson MT (eds). 1987, IRL Pres.
2. Apoptosis, Senescence and Cancer. Gewirtz DA, Halt SE, Grant S. (eds) 2nd ed. 2007, Humana Press.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Ders kuramsaldır. Sunumlar biçiminde gerçekleşmektedir. Ancak öğrencini verilen kaynakları okumuş olarak derse gelmesi beklenmektedir. Ayrıca dönem içinde verilecek bir makale ödevinin öğrenci tarafından sunum olarak hazırlanması istenmektedir.

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	VZ	Ara Sınav
2	PRJ	Proje
3	FN	Final
4	BNS	Başarı	VZ * 0.40 + PRJ * 0.10 + FN* 0.50
5	BUT	Bütünleme Notu
6	BBN	Bütünleme Sonu Başarı Notu	VZ * 0.40 + PRJ * 0.10 + BUT* 0.50

*** Bütünleme Sınavı Yapılmayan Birimlerde Bütünleme Kriteri Dikkate Alınmaz.

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

Kavrama, öğrenme, analiz etme, karşılaştırma, interaktif katılım.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

Prof. Dr. Kemal Baysal
Kemal.baysal@deu.edu.tr
232 412 4418

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

Çarşamba 10.30-12:15

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı	15	3	45
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar	14	3	42
Sunum Hazırlama	1	15	15
Final Sınavına Hazırlık	1	18	18
Vize Sınavına Hazırlık	1	18	18
Vize Sınavı	1	3	3
Final Sınavı	1	3	3
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat)			144

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK	PK.1	PK.6
ÖK.1	5
ÖK.2	5
ÖK.3	5
ÖK.4	5
ÖK.5	5
ÖK.6	5
ÖK.7	5
ÖK.8	5	5

DERS ADI

DERECE PROGRAMLARI