Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
CSE 5071	BİYO-ENFORMATİK ALGORİTMALARI	SEÇMELİ	3	0	0	6

Dersi Veren Birim

Fen Bilimleri Enstitüsü

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

DR.ÖĞR.ÜYESİ ZERRİN IŞIK

Dersi Alan Birimler

Bilgisayar Mühendisliği Yüksek Lisans
Bilgisayar Mühendisliği Tezsiz Yüksek Lisans
Biyomedikal Teknolojiler Yüksek Lisans (İng)
İleri Biyomedikal Teknolojiler Sanayi Ortak Doktora
İleri Biyomedikal Teknolojiler Sanayi Ortak Bütünleşik Doktora
Bilgisayar Mühendisliği Tezsiz Yüksek Lisans (İ.Ö)
Bilgisayar Mühendisliği Bütünleşik Doktora
Bilgisayar Mühendisliği Doktora

Dersin Amacı

Bu kdersin amacı öğrencilerin biyo-enformatik alanındaki veri saklama ve işleme problemlerini çözebilecek beceriler kazanmasıdır.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	Biyo-enformatik veri yapılarını ve tiplerini tanımlayabilmek
2	Biyo-enformatikte probabilistik ve istatistiksel metotları tanımlayabilmek
3	Biyo-enformatikte öğrenebilen algoritmaları tanımlayabilmek
4	Biyo-enformatik araştırma ve klinik ihtiyaçlar için veri işleme sorunlarını çözebilmek

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	Biyo-enformatik veri yapılarına giriş
2	Olasılık ve istatistiksel metotlar
3	Öğrenebilen algoritmaların temelleri
4	Sonlu durum makinaları
5	Yapay sinir ağları
6	Sınıflama algoritmaları
7	Ara sınav çözümleri
8	Grafiksel modeller
9	Örüntü tanıma
10	Mikroarray
11	Stokastik gramerler ve diller
12	Öğrenebilen algoritmalar
13	Biyo-enformatik temelli hesaplama
14	Uygulamalar ve özbakış

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Ders Kitabı:
Neil C. Jones and Pavel A. Pevzner, An Introduction to Bioinformatics Algorithms, The
MIT Press, 2004 (ISBN-13: 978-0262101066).
Yardımcı Kitaplar:
Baldi, P., Brunak S, Bioinformatics The Machine Learning (Second Edtn) , MIT Press,
2001,
Ewens WJ, Grant GR, Statistical Methods in Bioinformatics An Introduction, Springer,
2005.
Diğer: Lecture Notes,problem sets.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Dersler, Ödevler, Bağımsız çalışmalar

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	ARS	ARASINAV
2	ODV	ÖDEV
3	AOD	ARAŞTIRMA ÖDEVİ
4	DKT	DERSE KATILIM
5	YSBN	YIL SONU BAŞARI NOTU	ARS* 0.20 +ODV * 0.20 + AOD * 0.50 + DKT * 0.10

*** Bütünleme Sınavı Yapılmayan Birimlerde Bütünleme Kriteri Dikkate Alınmaz.

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar