DERS ADI

: KÖK HÜCRE GÖRÜNTÜLEME TEKNİKLERİ

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
SBE 0512 KÖK HÜCRE GÖRÜNTÜLEME TEKNİKLERİ SEÇMELİ 2 2 0 8

Dersi Veren Birim

Fen Bilimleri Enstitüsü

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

DOÇENT REMZİYE DEVECİ

Dersi Alan Birimler

İleri Biyomedikal Teknolojiler Sanayi Ortak Bütünleşik Doktora
İleri Biyomedikal Teknolojiler Sanayi Ortak Doktora

Dersin Amacı

Bu dersin amacı, kök hücre görüntüleme amacı ile kullanılan cihazları tanıtmak, çalışma prensipleri hakkında öğrencileri bilgilendirmek ve konu ile ilgili uygulama çalışmalarında deneyim kazanmasını sağlamaktır.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Kök hücrelerin görüntülenmesinde farklı mikroskop tekniklerinin kullanımını açıklayabilme ve uygulayabilme
2   Canlı incelemelerde kullanılabilecek mikroskop çeşitleri ve yöntemlerinin avantaj ve dezavantajlarını tartışabilme
3   Farklılaştırılan kök hücre karakterizasyonu için kullanılan görüntüleme tekniklerini anlayabilme ve uygulayabilme
4   Kök hücre görüntülemede kullanılan markırların çeşitleri, özellikleri, kullanım alanları ve kullanım şekillerini açıklayabilme

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Kök hücre görüntülemede kullanılan bazı cihazlar ve çalışma prensipleri (Mikroskop çeşitleri, flow sitometri, lazer taramalı sitometri, vb.) Kök hücre görüntülemede kullanılan bazı cihazların tanıtılması, çalışma prensiplerinin açıklanması ve incelemelerin gerçekleştirilmesi
2 Kök hücrelerin görüntülenmesi I: Işık mikroskobu teknikleri Işık mikroskobunda incelemeye uygun yöntemlerin uygulanması ve kök hücrelerin görüntülenmesi
3 Kök hücrelerin görüntülenmesi II: Floresan ve Konfokal Mikroskop teknikleri Floresan mikroskopta incelemeye uygun yöntemlerin uygulanması ve kök hücrelerin görüntülenmesi
4 Kök hücrelerin görüntülenmesi III: SEM preparasyon teknikleri SEM de kök hücre incelemeye uygun yöntemlerin uygulanması ve yöntemin tartışılması
5 Kök hücrelerin görüntülenmesi IV: TEM preparasyon teknikleri I: Doku preparasyon teknikleri TEM de doku yapısındaki kök hücreleri incelemeye uygun yöntemlerin uygulanması ve incelenmesi
6 Kök hücrelerin görüntülenmesi IV: TEM preparasyon teknikleri II: İzole hücrelerin, hücre agregatlarının ve kültüre hücrelerin preparasyon teknikleri TEM de kültürdeki kök hücreleri incelemeye uygun yöntemlerin uygulanması ve incelenmesi
7 Kök hücrelerin in vitro ve in vivo koşullarında canlı olarak incelenmesi Canlı incelemelerde kullanılabilecek mikroskop çeşitleri ve yöntemlerinin avantaj ve dezavantajlarının tartışılması
8 Ara sınav Ara sınav
9 Kök hücre görüntülemede kullanılan markırların çeşitleri, özellikleri, kullanım alanları ve kullanım şekli Kök hücre tiplerine uygun markırların seçilmesi ve uygulanması
10 Kök hücre görüntülemede nanoteknoloji Kök hücre görüntülemede kullanılan nanomateryallerin ve uygulama yöntemlerinin araştırılması ve tartışılması
11 Kanser kök hücrelerinin görüntülenmesi Kanser kök hücrelerinin kültür ortamında çoğaltılması ve mikroskopta incelenmesi
12 Terapi amaçlı kök hücre implantlarının görüntülenmesi Literatürden alınan farklı tekniklerle gösterilen implantlara ait fotoğrafların incelenmesi ve tartışılması
13 Farklılaştırılan kök hücre karakterizasyonu için kullanılan görüntüleme teknikleri I: Histoloji, Histokimya, İmmunohistokimya, İmmunfloresan, Sitoloji, Sitokimya, İmmunsitokimya, İmmungold, GFP) Mezenkimal kök hücrelerden farklılaştırılan kemik, kıkırdak veya yağ hücreleri için histokimyasal boyamaların gerçekleştirilmesi ile farklılaşmanın karakterizasyonu (Osteojenik farklılaşma için alizarin kırmızısı, kondrojenik farklılaşma için alcian mavisi, adipojenik farklılaşma için oil red O)
14 Farklılaştırılan kök hücre karakterizasyonu için kullanılan görüntüleme teknikleri II (FISH, kromatin görüntüleme, nanoişaretleme, cell sorting, immunfenotip, genetik etiketleme, radioimmunassay, flow sitometri, antikor ve markır kullanımı) Nişlerin görüntülenmesi Hematopoetik vb. kök hücre nişlerinin görüntülenmesi Kondrojenik farklılaşma için kollagen II ye spesifik antikor kullanımı ile farklılaşmanın karakterizasyonu ve TEM de sitolojik incelemelerle karakterizasyon.

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

İlgili yayınlar

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Proje ve sınavlar

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO KISA KOD UZUN ADI FORMUL
1 ARS ARASINAV
2 ODV ÖDEV
3 YSS YIL SONU SINAVI
4 YSBN YIL SONU BAŞARI NOTU ARS * 0.20 + ODV * 0.20 + YSS * 0.60
5 BUT BÜTÜNLEME
6 BUTBN BÜTÜNLEME SONU BAŞARI NOTU ARS * 0.20 + ODV * 0.20 + BUT * 0.60


*** Bütünleme Sınavı Yapılmayan Birimlerde Bütünleme Kriteri Dikkate Alınmaz.

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

İlan Edilecektir.

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 14 2 28
Uygulama 14 2 28
Sunum Hazırlama 1 9 9
Kitap Okuma 14 2 28
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 14 4 56
Vize Sınavına Hazırlık 1 28 28
Final Sınavına Hazırlık 1 28 28
Final Sınavı 1 2 2
Vize Sınavı 1 2 2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 209

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8PK.9PK.10
ÖK.14
ÖK.24
ÖK.3545
ÖK.45