DERS ADI

: TRANSKRİPTOMİK ANALİZ VE YÖNTEMLERİ

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
MBG 6107 TRANSKRİPTOMİK ANALİZ VE YÖNTEMLERİ SEÇMELİ 3 0 0 12

Dersi Veren Birim

Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

PROFESÖR ŞERİFE ESRA ERDAL BAĞRIYANIK

Dersi Alan Birimler

Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora
İngilizce Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Doktora

Dersin Amacı

Bu dersin amacı bitki genetiği ve genomiğinin son gelişmelerini ve uygulamalarını ve tarımsal verimliliği ve kaliteyi arttırma potansiyellerini tartışmak ve bitki moleküler mekanizmasını tanımlamaktır.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   RNA biyolojisinin temelini kavrayabilme
2   Bitki iyileştirmesi için transkriptomik dizileme ve biyoenformatiklerin son uygulamaları hakkında bilgi vermek
3   Streslerden kaynaklanan ürün kaybı problemlerini bilmek
4   Düzenleyici mekanizmaları bilmek
5   Transkriptomik analizlerin temellerini kavrayabilme

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Ökaryotik Hücrelerin Temel Genetiği
2 Arabidopsis thaliana, model çiçekli bitki
3 Biyoenformatik ve Biyoenformatik araçlara giriş
4 Transcriptom analizi
5 Genomik ve transkriptomik yaklaşımlar
6 RNA Biyolojisi
7 Ara sınav
8 Omik Yaklaşımları
9 Bitkilerin RNA Dünyası
10 Kodlanmayan bitki RNAları
11 Küçük RNAlar
12 Transpozonlar
13 Transgenik bitkiler
14 Bitki omikleri
15 Genom Düzenleme
16 Final Sınavı

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Textbook(s): From Plant Genomics to Plant Biotechnology, Elsevier, ISBN: 978-1-907568-29-9
Supplementary Book(s): Rnai: A Guide to Gene Silencing (Manual) Gregory J. Hannon (Author, Editor). Cold Spring Harbor Laboratory Pres. ISBN-10: 0879696419, 2004
References: Plant Bioinformatics, ISBN 978-1-59745-535-0, Springer
Materials: Genebanks, miRBase, NCBI genome, SRA and transcriptome databases, RFAM

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

1- Ders Anlatımı
2- Sorular ve Cevaplar
3- Tartışma
4- Ödev

Değerlendirme Yöntemleri

Başarılı / Başarısız


*** Bütünleme Sınavı Yapılmayan Birimlerde Bütünleme Kriteri Dikkate Alınmaz.

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok.

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

İlan Edilecektir.

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 14 3 42
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 14 7 98
Vize Sınavına Hazırlık 1 25 25
Final Sınavına Hazırlık 1 30 30
Ödev Hazırlama 5 8 40
Ödev Hazırlama 2 8 16
Sunum Hazırlama 3 15 45
Final Sınavı 1 2 2
Vize Sınavı 1 2 2
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 300

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8
ÖK.14
ÖK.24
ÖK.31
ÖK.42
ÖK.52