• ANASAYFA
• ÜNİVERSİTE HAKKINDA
  • İsim - Adres
  • Genel Bilgi
  • Üniversite Yönetimi
  • Akademik Takvim
  • Derece Programları
  • Yabancı Dilde Eğitim Veren Birimler
  • Genel Kabul ve Kayıt Koşulları
  • Kredi Hareketliliği ve Önceki Öğrenmenin Tanınması
  • AKTS Kredilerinin Belirlenmesi
  • Akademik Danışmanlık
  • İletişim
• DERECE PROGRAMLARI
  • Doktora Programları
  • Yüksek Lisans Programları
  • Lisans Programları
  • Önlisans Programları
• ÖĞRENCİ İÇİN GENEL BİLGİLER
  • Yaşam Standardı
  • Barınma
  • Beslenme
  • Sağlık
  • Engelli İçin Olanaklar
  • Sigorta
  • Finansal Destekler
  • Öğrenci İşleri Daire Başkanlığı
  • Uluslararası Öğrenciler için Pratik Bilgiler
  • Dil Kursları
  • Staj Olanakları
  • Sportif, Sosyal ve Kültürel Faaliyetler
  • Öğrenci Toplulukları ve Kulüpler
  • İzmir-Türkiye Hakkında
• ULUSLARARASI İLİŞKİLER
  • Dış İlişkiler Koordinatörlüğü
  • Kayıt İşlemleri
  • Anlaşmalar
  • Koordinatörler
  • Belgeler
  • Yabancı Dilde Eğitim Veren Birimler
  • AKTS/DE Etiketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS MBG 6112 BİYOİNFORMATİK VERİTABANLARI SEÇMELİ 3 0 0 12

Dersi Veren Birim

Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

DR.ÖĞR.ÜYESİ GÖKHAN KARAKÜLAH

Dersi Alan Birimler

Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora İngilizce Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Doktora

Dersin Amacı

Bu ders, öğrencilere kamuya açık genel biyoinformatik veritabanları hakkında bilgi vermeyi amaçlamaktadır. Buna ek olarak, öğrenci yararlı bilgileri elde edebilecek ve bilgi kaynakları ve veritabanlarından alınan verileri birbirine bağlayabilecektir.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Kamuya açık genel biyoinformatik ve moleküler biyoloji veritabanlarını bilmek 2   Kamuya açık veritabanlarından yararlı bilgileri çıkarmak. 3   Hipotez testinde sık karşılaşılan problemleri çözmek için uygun veri kaynağını seçebilme 4   Moleküler biyoloji ve biyoinformatik veritabanları ile ilgili zorlukların farkında olmak 5   Çeşitli veritabanlarının çıktılarını nasıl bağlayacağını bilmek

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama 1 Moleküler biyoloji ve biyoinformatik veritabanlarına giriş 2 Bibliyografik veritabanları 3 Nükleotid sekans veritabanları (nükleotid, gen yapısı, düzenleyici sekans veritabanları) 4 RNA dizisi veritabanları 5 Protein dizisi veritabanları (genel, protein özellikleri, yerelleştirme ve hedefleme veritabanları) 6 Protein dizisi veritabanları (motif, aktif siteler, etki alanı ve sınıflandırma veritabanları) 7 Nükleik asit, protein ve küçük molekül yapısı veritabanları 8 Omurgalı olmayan genomik veritabanları 9 ARA SINAV 10 Model organizmalar ve karşılaştırmalı genomik veritabanları 11 İnsan genomu veritabanları, haritalar ve genom görüntüleyicileri 12 Metabolik ve sinyal yolağı veri tabanları 13 İnsan genleri ve hastalıkları veri tabanları 14 Gen ifadesi, hücre biyolojisi ve immünolojik veritabanları 15 Ödev Sunumları 16 Final sınavı

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Ana kaynak: Nucleic Acids Research (Database issue), Online ISSN 1362-4962 - Print ISSN 0305-1048

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Powerpoint ile teorik anlatım ve literatür taraması / tartışması.

Değerlendirme Yöntemleri

Başarılı / Başarısız *** Bütünleme Sınavı Yapılmayan Birimlerde Bütünleme Kriteri Dikkate Alınmaz.

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

gokhan.karakulah@deu.edu.tr

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat) Lectures 14 3 42 Preparation before/after weekly lectures 14 6 84 Preparation for Mid-term Exam 1 30 30 Preparation for Final Exam 1 37 37 Preparing Individual Assignments 12 5 60 Preparing Presentations 2 20 40 Final 1 3 3 Mid-term 1 4 4 TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 300

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK PK.1 PK.2 PK.3 PK.4 PK.5 PK.6 PK.7 PK.8 ÖK.1 3 ÖK.2 3 ÖK.3 3 ÖK.4 3 ÖK.5 3