DERS ADI

: İLERİ MİKROORGANİZMA GENETİK VE GENOM BİLİMİ

Ders Bilgileri

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü D U L AKTS
MBG 6126 İLERİ MİKROORGANİZMA GENETİK VE GENOM BİLİMİ SEÇMELİ 3 0 0 12

Dersi Veren Birim

Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora

Dersin Düzeyi

Doktora

Ders Koordinatörü

DR.ÖĞR.ÜYESİ YAVUZ OKTAY

Dersi Alan Birimler

Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora

Dersin Amacı

Mikrobiyal konsorsiyumların karakterizasyonu için omik çalışmaların tasarımı ve analizi konusunda ileri düzeyde bir bakış açısı sağlamak.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1   Mikrobiyal genomların yapısını ve fonksiyonel organizasyonunu tartışmak
2   Metagenomik metodlarını açıklamak
3   Metagenomiğin tıptaki uygulamalarını tanımlamak
4   Metagenomiğin biyoteknolojideki uygulamalarını tanımlamak
5   Ortaya çıkan teknolojilerin mikrobik genomik uygulamaları üzerine potansiyel etkilerini tartışmak

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta Konular Açıklama
1 Mikrobiyal Genetiğin Temelleri
2 Bakteri Genetiği Analizi: Forward ve Reverse
3 Bakteriyolojide Metagenomik
4 İnsan Mikrobiyomunu Keşfetmek için Bir Araç Olarak Yüksek Verimli Sekanslama
5 Metagenomik Uygulamalar için SMRT DNA Dizilimi
6 Mikrobiyal Transkriptomik
7 Shotgun Metagenomlarının Taksonomik Mikrobiyom Profillemesi için Hesaplamalı Araçlar
8 Vize Sınavı
9 Metagenomik Verilerin Hipotez Testi
10 Boyuna Mikrobiyom Verileri Analizi
11 İnsan Varyomunun Anlaşılmasına Doğru
12 Endüstriyel Biyoprodüktörler için Metagenomik Uygulamaları
13 Metagenomiğin Biyoremediasyona Uygulanması
14 Metagenomik Yöntemlerle Bitki-Mikrop Etkileşimlerinin İncelenmesi
15 Mikrobiyoloji Çalışmalarının Vaat ve Beklentileri
16 Final Sınavı

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

Textbook(s):
Metagenomics for Microbiology, 1st Edition, by Jacques Izard and Maria Rivera (eds), Academic Press, 2014
ISBN-13: 978-0124104723

Supplementary Book(s): Brock Biology of Microorganisms, 13th Edition, by Michael T. Madigan, John M. Martinko, David Stahl, and David P. Clark, Benjamin-Cummings, 2010
ISBN: 978-0321649638

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

PowerPoint ile teorik dersler
Son araştırma makaleleri ve incelemelerinin tartışılması

Değerlendirme Yöntemleri

Başarılı / Başarısız


*** Bütünleme Sınavı Yapılmayan Birimlerde Bütünleme Kriteri Dikkate Alınmaz.

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Dili

İngilizce

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

Yavuz.oktay@deu.edu.tr
Phone: 412 6555

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

İlan Edilecektir.

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler Sayısı Süresi (saat) Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı 14 3 42
Haftalık Ders öncesi/sonrası hazırlıklar 14 7 98
Vize Sınavına Hazırlık 1 28 28
Final Sınavına Hazırlık 1 35 35
Ödev Hazırlama 3 9 27
Ödev Hazırlama 1 11 11
Sunum Hazırlama 1 20 20
Proje Hazırlama 1 30 30
Final Sınavı 1 5 5
Vize Sınavı 1 5 5
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat) 301

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖKPK.1PK.2PK.3PK.4PK.5PK.6PK.7PK.8
ÖK.12
ÖK.22
ÖK.33
ÖK.43
ÖK.53