Dokuz Eylül Üniversitesi Ders Katoloğu / Bilgi Paketi

Ders Bilgileri

Ders Kodu	Ders Adı	Ders Türü	D	U	L	AKTS
ONK 5046	KANSER ARAŞTIRMALARINDA LABORATUVAR II	SEÇMELİ	2	2	0	4

Dersi Veren Birim

Temel Onkoloji Yüksek Lisans

Dersin Düzeyi

Yüksek Lisans

Ders Koordinatörü

DOÇENT YASEMİN BASKIN

Dersi Alan Birimler

Temel Onkoloji Yüksek Lisans

Dersin Amacı

Bu ders kapsamında, Öğrencileri, kanser araştırmaları laboratuarları hakkında bilgilendirmek, analitik olarak yeni teknolojileri tanıtmak ve uygulatmak; bu alanda yapılacak proje ve bilimsel çalışmalara adaptasyonlarını sağlamak amaçlanmıştır.

Dersin Öğrenme Kazanımları

1	Genel Laboratuvar kurallarını, çalışma yönergelerini bilir (bilgi)
2	PCR türleri, mikroarrayler, hibridizasyon, flow sitometri, sitotoksisite, apoptoz analiz yöntemlerinin temel prensiplerini bilir (bilgi)
3	Hibridizasyon temelindeki laboratuvar analiz yöntemlerini uyarlar (kavrama)
4	Onkoloji alanındaki çalışmalarda gerekli özellikli örnek hazırlığını dökümante ederek uygular (sentez)
5	RCR, RT PCR, sitotoksisite, apoptoz tekniklerini uygular (sentez)
6	Uyguladığı yöntemlerin sonuçlarını yorumlar (değerlendirme)
7	Kanser araştırmalarının literatürde yer alan yöntemlerini anlar ve kendi uygulamalarına uyarlar(analiz)

Dersin Öğretim Türü

Örgün Öğretim

Dersin Önkoşulu/Önkoşulları

Yok

Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders İçeriği

Hafta	Konular	Açıklama
1	İleri Tekniklerde Analizin ilkeleri	U:Optimizasyon Kavramı
2	Kanser Genetiğinde moleküler teknikler, Kanserde Genetik markerlar,	U:Validasyon Kavramı
3	Kanser araştırmalarında DNA ve RNA analizi,	U:Biyomarker Tanımlama stratejileri
4	Kansere özgü Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) uygulamaları, Kansere özgü Real time PCR uygulamaları	U:Metod karşılaştırma, yöntemlerin uygulama istatistikleri, ileri yönytemlerde biyoinformatik
5	Kansere özgü Mutasyon tespit teknikleri,	U:Nükleik asit izolasyon teknikleri
6	Kanser araştıramlarında Blotlama teknikleri (Western, Southern, Northern),	U:Nükleik asitlerle çalışma teknikleri
7	Kanserde DNA mikroarray,	U:Jel ve nükleik asit ayrıştırma, blotlama teknikleri
8	Kanser hücre yolaklarına özgü teknikler (hücre siklüsü, apoptoz, sitotoksiiste)	U:PCR tekniği,
9	Kansere özgü immunohistokimyasal teknikler,	U:RT-PCR
10	Kanserde Flowsitometri,	U:DNA dizileme
11	Kanserde Karşılaştırmalı Genomik Hibridizasyon,	U:Hücre Ayırma-ayrımlama teknikleri
12	Kanserde Allel spesifik oligonükleotid hibridizasyonu, Kanserde Insitu hibridizasyon	U:TUNEL ve Apoptoz boyama
13	Kansere özgü Protein Analizleri,	U:Akım sitometri
14	Rekombine DNA teknolojisine genel bakış,	U:mikroarray tekniği
15	Kanser Hücre kültürüne giriş	U: Metod Yazımı

Ders İçin Önerilen Kaynaklar

: Ana kaynak: Prof.Dr. Ahmet Münir KINAY,Prof.Dr. Ahmet Uğur YILMAZ,Prof.Dr. Hülya ELLİDOKUZ,Prof.Dr.Safiye AKTAŞ,Doç.Dr. Zekiye Sultan ALTUN, Yrd.Doç.Dr. Yasemin BASKIN,MSc. Pınar,Erçetin,YL Öğr Gizem Çalıbaşı,"Temel Onkolojide Kullanılan Araştırma Yöntemleri", Dokuz Eylül Üniversitesi Matbaası, İzmir,978-975-441-330-4,(2011) ,El Kitabı(Handbook)
Yardımcı kaynaklar: Pathologic Basis of Disease. Vinay Kumar, Abul K. Abbas, Nelson Fausto, Elsevier Saunderss, 2005 Seventh Edition; The Biology of Cancer Robert A. Weinberg, Gariand Science 2007; Moleküler Biyoloji, Editör: Ahmet Yıldırım Nobel Yayın Dağıtım; Ankara, 2010,
Referanslar:
Diğer ders materyalleri: Pubmed ve diğer akademik tarama ortamları.

Öğrenme ve Öğretme Yöntemleri

Teorik ders anlatımı, konuların ders içi etkinliklerle (sunum ve ödevlerle) pekiştirilmesi ve tartışılması, laboratuvar uygulamaları ve uygulama ödevleri

Değerlendirme Yöntemleri

SIRA NO	KISA KOD	UZUN ADI	FORMUL
1	VZ	Arasınav
2	ODV	Ödev
3	LAB	Lab/Uygulama
4	FN	Final
5	BNS	Başarı	VZ * 0.20 + ODV * 0.10 + LAB* 0.20 + FN*0.50
6	BUT	Bütünleme
7	BBN	BütSonuBaşarıNotu	VZ* 0.20 + ODV * 0.10 + LAB* 0.20 + BUT*0.50

Değerlendirme Yöntemlerine İliskin Aciklamalar

Yok

Değerlendirme Kriteri

1.Genel Laboratuvar kurallarını, çalışma yönergelerini bilir (bilgi),2. PCR türleri, mikroarrayler, hibridizasyon, flow sitometri, sitotoksisite, apoptoz analiz yöntemlerinin temel prensiplerini bilir (bilgi), 3. hibridizasyon temelindeki laboratuvar analiz yöntemlerini uyarlar (kavrama)bilgi ve kavrama düzeyi sınav ile;
4.Onkoloji alanındaki çalışmalarda gerekli özellikli örnek hazırlığını dökümante ederek uygular (sentez), 5. RCR, RT PCR, sitotoksisite, apoptoz tekniklerini uygular (sentez)
laboratuvar uygulamaları ve uygulama ödevleri ile;
6. Onkoloji alanındaki çalışmalarda gerekli örnek hazırlığını dökümante ederek uygular; Uyguladığı yöntemlerin sonuçlarını yorumlar (değerlendirme), 7. Kanser araştırmalarının literatürde yer alan yöntemlerini anlar ve kendi uygulamalarına uyarlar(analiz),çıktıları ödev, sunum ve sınav ile değerlendirilir.

Dersin Öğretim Dili

Türkçe

Derse İlişkin Politika ve Kurallar

İlan Edilecektir.

Dersin Öğretim Üyesi İletişim Bilgileri

yasemin.baskin@deu.edu.tr ; 0 232 412 58 90

Ders Öğretim Üyesi Görüşme Gün ve Saatleri

pazartesi 13:30-16:00

Staj Durumu

YOK

İş Yükü Hesaplaması

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ders Anlatımı	15	2	30
Uygulama	15	1	15
Vize Sınavına Hazırlık	1	15	15
Final Sınavına Hazırlık	1	18	18
Ödev Hazırlama	1	10	10
Sunum Hazırlama	1	10	10
Final Sınavı	1	1	1
Vize Sınavı	1	1	1
TOPLAM İŞ YÜKÜ (saat)			100

Program ve Öğrenme Kazanımları İlişkisi

PK/ÖK	PK.1	PK.2	PK.3	PK.4	PK.5	PK.6	PK.7	PK.8	PK.9	PK.10
ÖK.1	5				5				5	5
ÖK.2	5				5				5	5
ÖK.3	5				5				5	5
ÖK.4	5	5	5				5		5
ÖK.5	5				5		5	5	5	5
ÖK.6	5			5	5	5	5	5	5	5
ÖK.7	5				5		5		5	5

DERS ADI

DERECE PROGRAMLARI